湖泊主题

　　针对我国湖泊富营养化及流域水污染问题，全面掌握流域污染源和社会经济发展情况，及其与湖泊水质变化、富营养化之间的相应关系，初步提出解决我国湖泊水污染和富营养化治理的基本理论体系框架，研发不同类型湖泊水污染治理和富营养化控制自主创新的关键技术，形成湖泊水污染和富营养化控制的总体方案。

　　河流主题

　　针对我国河流水污染严峻的现状，选择不同地域、类型、污染成因和经济发展阶段分异特征的典型河流，创立符合不同水质目标和功能目标的河流管理支撑技术体系，制定与我国不同区域经济水平和基本水质需求相适应的污染河流(段)水污染综合整治方案;重点突破一批清洁生产、水循环利用和点、面源污染负荷削减关键技术及集成技术，污染河流(段)治理与生态修复的集成技术，以及河流污染预防、控制、治理与修复的技术系统;选择具有典型性和代表性的河流开展工程示范。

　　城市水环境主题

　　通过实施城市水污染控制与水环境综合整治关键技术研究与示范主题，识别我国城市水污染的时空特征和变化规律，建立不同使用功能的城市水环境和水排放的标准与安全准则，为构建新一代城市水环境系统提供强有力的技术支持和管理工具。

　　饮用水主题

　　结合典型区域的水源污染和供水系统的特征，通过关键技术研发、技术集成和应用示范，构建针对水源保护—净化处理—输配全过程的饮用水安全保障技术;集水质监控、风险评估、运行管理、应急处置于一体的标准和监管管理体系，为全面提升我国饮用水安全保障技术水平、促进相关产业发展以及强化政府监管能力提供科技支撑，持续提升我国饮用水安全保障能力，为保障人民群众的饮水安全和身体健康提供技术支撑。

　　流域监控主题

　　针对我国流域水环境问题，通过实施“流域水污染防治监控预警技术与综合示范”研究，促进流域水污染防治监控的理念创新、技术创新和管理创新，以流域水质保障与水生态安全为目标，以强化流域水质系统管理，形成监控、预警能力为重点，开展流域水生态功能区划、流域水质目标管理、水环境监测、水环境风险评估、水环境预警和流域水污染防治综合决策等技术研究，构建适合我国水污染特征的流域水污染防治综合管理体系，建立水污染控制技术评估系统和评估技术平台，支撑流域水环境管理和决策，从而保障国家环境与经济、社会的协调可持续发展。

　　战略与政策主题

　　围绕构建水环境管理决策技术平台、理顺水环境管理“生产关系”、提高水环境管理政策“生产力”等三大支撑，明确国家中长期水污染控制路线图，提出水环境管理体制创新、制度创新、政策创新主要方向，改进和完善水污染控制管理机制，增强市场经济手段在水污染控制中的作用，明确政府、企业在水环境保护中的责任，提高水污染控制的投入和效率，强化监督管理和政策执行能力，提高经济政策的实施效果和执行效率，为实现水专项“示范区”水质改善和国家水污染防治目标提供管理和政策机制。